番茄褐色皱纹果病毒分子检测与鉴定
王少骅,陈利达,石延霞,谢学文,李磊,范腾飞,李宝聚*,柴阿丽*
中国农业科学院蔬菜花卉研究所,蔬菜生物育种全国重点实验室,北京 100081
Molecular Detection and Identification of Tomato brown rugose fruit virus
WANG Shaohua,CHEN Lida,SHI Yanxia,XIE Xuewen,LI Lei,FAN Tengfei,LI Baoju*,CHAI #br# Ali* #br#
Institute of Vegetables and Flowers,Chinese Academy of Agricultural Sciences,State Key Laboratory of Vegetable Biobreeding,Beijing 100081,China
摘要 利用 3 对番茄褐色皱纹果病毒(Tomato brown rugose fruit virus,ToBRFV)特异性引物对云南红河、宁夏银川、北京顺义疑似病毒病样本进行 RT-PCR 检测,分别扩增出大小为 812、842、1 053 bp 的特异性条带。对扩增产物进行测序及系统进化分析,发现云南、宁夏、北京的 ToBRFV 分离物与约旦、意大利、荷兰的 ToBRFV 分离物聚在同一分支上,亲缘关系较近。致病性结果显示,接种后的番茄植株表现出与田间相同的症状,且在发病组织中检测到病毒 ToBRFV。表明来自云南红河、宁夏银川、北京顺义的番茄植株均被ToBRFV侵染。
关键词 :
番茄褐色皱纹果病毒 ,
分子检测 ,
ToBRFV ,
RT-PCR
Abstract :RT-PCR detection was carried out on suspected viral disease samples collected from Honghe,Yunnan Province,Yinchuan,Ningxia Hui Autonomous Region and Shunyi,Beijing,by using 3 pairs of specific primers for Tomato brown rugose fruit virus(ToBRFV).Specific fragments with size as 812 bp,842 bp and 1 053 bp were amplified,respectively.Sequencing and phylogenetic analysis were conducted
on these amplified products.We discovered that ToBRFV isolates from Yunnan,Ningxia and Beijing were clustered on the same branch as ToBRFV isolates from Jordan,Italy and the Netherlands.They were closer relatives.Pathogenic result displayed that after inoculation,tomato plants showed the same symptoms as in the fields.Moreover,ToBRFV was detected in the diseased tissues,indicating that tomato plants collected from Yunnan,Ningxia and Beijing were all infected by ToBRFV.
Key words :
Tomato brown rugose fruit virus
molecular detection
ToBRFV
RT-PCR
收稿日期: 2022-08-25
基金资助: 国家重点研发计划项目(2022YFD1601504),宁夏回族自治区重点研发计划项目(2021BBF02002)
通讯作者:
柴阿丽,女,副研究员,硕士生导师,专业方向:蔬菜病害诊断,E-mail:chaiali@caas.cn;李宝聚,男,研究员,博士生导师,专业方向:蔬菜病害综合防治,E-mail:libaoju@caas.cn
作者简介 : 王少骅, 女, 硕士研究生, 专业方向: 蔬菜病害诊断,E-mail:3163758116@qq.com
引用本文:
王少骅,陈利达,石延霞,谢学文,李磊,范腾飞,李宝聚*,柴阿丽*. 番茄褐色皱纹果病毒分子检测与鉴定[J]. 中国蔬菜, 2023, 1(6): 34-40.
WANG Shaohua,CHEN Lida,SHI Yanxia,XIE Xuewen,LI Lei,FAN Tengfei,LI Baoju*,CHAI Ali* . Molecular Detection and Identification of Tomato brown rugose fruit virus. China Vegetables, 2023, 1(6): 34-40.
链接本文:
https://www.cnveg.org/CN/ 或 https://www.cnveg.org/CN/Y2023/V1/I6/34
[1]
武亚芬,向丹,李琳,梁斌*. 寿光设施番茄尖孢镰刀菌的分离、鉴定及番茄品种感病研究 [J]. 中国蔬菜, 2023, 1(4): 70-78.
[2]
卡地尔阿依·买买提1,李志卫3,韩盛2,杨渡2,玉山江·麦麦提2*,麦合木提江·米吉提1*. 喀什地区甜瓜田间杂草3种病毒的检测及分析 [J]. 中国蔬菜, 2023, 1(4): 64-69.
[3]
陈灵芝,王兰兰,张茹,张玉鑫,高彦萍. 甘肃省辣椒斑萎病毒的检测 [J]. 中国蔬菜, 2023, 1(3): 73-77.
[4]
康华军,李建设,高艳明,史娟,石延霞,谢学文,李磊,范腾飞,李宝聚,柴阿丽. 宁夏银川地区番茄斑萎病毒和南方番茄病毒复合侵染分子鉴定 [J]. 中国蔬菜, 2022, 1(4): 29-34.
[5]
刘建青,王韬远,李小宇,张春雨,苏颖,魏健,张金花,王永志. 洋葱黄矮病毒的实时荧光RT-PCR 检测方法 [J]. 中国蔬菜, 2022, 1(3): 72-77.
[6]
胡荣,冯丽肖,张宇,张松柏,张德咏,刘勇. 我国6个省份番茄褪绿病毒和番茄黄化曲叶病毒复合侵染率及序列系统发育分析 [J]. 中国蔬菜, 2020, 1(9): 31-35.
[7]
张宇,张松柏,张德咏,刘慧,张战泓,张友军,刘勇. 番茄褐色皱纹果病毒的发生分布及防控对策 [J]. 中国蔬菜, 2020, 1(5): 12-17.
[8]
李玉琦 李秋丽 王雅丽 黄珊珊 胡 超 肖婉露 黄雅敏 赵鹏飞 黄 伟. 马铃薯Y 病毒实时荧光定量RT-PCR 检测体系的建立及应用 [J]. 中国蔬菜, 2020, 1(12): 22-27.
[9]
刘东让,侯喜林,肖栋. 普通白菜1,5- 二磷酸核酮糖羧化/ 加氧酶小亚基基因BcrbcS 的克隆及表达分析 [J]. 中国蔬菜, 2019, 1(1): 20-25.
[10]
陈灵芝1 张 茹1 魏兵强1 王兰兰1 高彦萍2 张 武2. 辣椒ToMMV 的分子鉴定 [J]. 中国蔬菜, 2018, 1(6): 39-43.
[11]
余辛,冯黎霞,章柱,武目涛,李新浩,丁钿. 从土耳其进境番茄种子上首次截获番茄斑萎病毒 [J]. 中国蔬菜, 2018, 1(11): 18-21.
[12]
刘永光,代惠洁,杨园园,陈鹏,竺晓平,赵静. 山东地区茄子感染番茄褪绿病毒的分子鉴定 [J]. 中国蔬菜, 2017, 1(9): 41-46.
[13]
孙红,苏同兵,于拴仓,张凤兰,余阳俊,张德双,赵岫云 . 白菜叶片表皮蜡粉成分及合成相关基因表达分析 [J]. 中国蔬菜, 2017, 1(7): 42-48.
[14]
乔 宁, 王兴翠, 田素波, 刘永光, 姜会霞, 李美芹, 竺晓平. 黄瓜上甜瓜黄斑病毒寿光分离物的初步鉴定及序列分析 [J]. 中国蔬菜, 2015, 1(7): 25-.
[15]
胡京昂 万秀娟 李自娟 黄 文 李武高 应芳卿. 河南番茄褪绿病毒的分子鉴定 [J]. 中国蔬菜, 2015, 1(12): 25-28.