以高抗炭疽病的辣椒材料PBC932（Capsicum chinense）为父本，以感病辣椒材料77013（Capsicum annuum）为母本和回交亲本，获得包含220 个和129 个单株的BC3S1 和BC4S1 群体材料，通过对各群体进行尖孢炭疽菌（Colletotrichum acutatum）抗性鉴定和SNP（KASPar）分子标记分析，发现UN27353_1781 标记与辣椒绿熟期炭疽病抗性基因AnRGO5 紧密连锁，遗传距离为2 cM。进一步利用标记UN27353_1781 对BC4S2 群体124 个单株进行分子标记分型，选择准确率达92.9%，表明该标记可有效用于辣椒抗炭疽病分子标记辅助育种。